Xuất hóa đơn hợp đồng hợp tác kinh doanh đóng vai trò then chốt giúp doanh nghiệp thực hiện đúng nghĩa vụ thuế và minh bạch hóa hoạt động hợp tác. Thủ tục này đòi hỏi sự chính xác về hình thức, nội dung và thời điểm xuất hóa đơn để tránh các rủi ro pháp lý. Việc nắm vững quy trình mới sẽ hỗ trợ doanh nghiệp vận hành hiệu quả hơn. Cùng ACC Cần Thơ tìm hiểu chi tiết.

1. Hướng dẫn xuất hóa đơn hợp đồng hợp tác kinh doanh mới
Trước khi xuất hóa đơn hợp đồng hợp tác kinh doanh, các bên cần xác định rõ mô hình hợp tác, nội dung giao dịch và bên trực tiếp bán hàng hóa, cung cấp dịch vụ cho khách hàng. Hợp đồng hợp tác kinh doanh không làm phát sinh pháp nhân mới, do đó việc phân chia doanh thu, chi phí hoặc lợi nhuận giữa các bên không phải là căn cứ duy nhất để xác định bên lập hóa đơn.
Khi phát sinh hoạt động bán hàng hóa hoặc cung cấp dịch vụ thuộc trường hợp phải lập hóa đơn, bên thực hiện giao dịch với khách hàng phải lập hóa đơn theo quy định. Việc lập hóa đơn phải căn cứ vào bản chất giao dịch thực tế và thời điểm lập hóa đơn theo Điều 9 Nghị định số 254/2026/NĐ-CP.
2. Các quy định pháp lý cần tuân thủ khi xuất hóa đơn
Hoạt động lập hóa đơn trong hợp đồng hợp tác kinh doanh được thực hiện theo Luật Quản lý thuế số 108/2025/QH15, Nghị định số 254/2026/NĐ-CP và Thông tư số 91/2026/TT-BTC. Theo Điều 4 Nghị định số 254/2026/NĐ-CP, người bán hàng hóa, cung cấp dịch vụ thuộc trường hợp phải lập hóa đơn thì phải lập hóa đơn và giao cho người mua.
Thời điểm lập hóa đơn phải xác định theo Điều 9 Nghị định số 254/2026/NĐ-CP. Đối với dịch vụ, về nguyên tắc là thời điểm hoàn thành việc cung cấp dịch vụ; trường hợp thu tiền trước hoặc trong khi cung cấp dịch vụ thì thực hiện theo quy định tương ứng.
Hóa đơn phải có các nội dung theo Điều 10 Nghị định số 254/2026/NĐ-CP, phù hợp với từng loại hóa đơn và giao dịch phát sinh. Doanh nghiệp không cần thể hiện tỷ lệ phân chia lợi nhuận của các bên trên hóa đơn nếu nội dung này không phải là chỉ tiêu bắt buộc.
3. Hồ sơ và điều kiện chuẩn bị trước khi xuất hóa đơn
Trước khi lập hóa đơn, các bên cần rà soát hợp đồng hợp tác kinh doanh để xác định phạm vi công việc, bên trực tiếp giao dịch với khách hàng và phương thức phân chia doanh thu, chi phí. Đồng thời, cần đối chiếu hồ sơ thực tế để xác định chính xác giá trị hàng hóa, dịch vụ đã cung cấp.
Các hồ sơ nên được chuẩn bị và đối chiếu gồm:
- Hợp đồng hợp tác kinh doanh và phụ lục hợp đồng;
- Biên bản nghiệm thu hoặc xác nhận hoàn thành dịch vụ, giao hàng;
- Hồ sơ xác nhận doanh thu và chi phí phát sinh;
- Chứng từ giao nhận, thanh toán và các tài liệu liên quan;
- Văn bản ủy quyền nếu có việc ủy quyền thực hiện công việc.
Hồ sơ này giúp doanh nghiệp xác định đúng bên lập hóa đơn, thời điểm lập hóa đơn và số tiền cần thể hiện trên hóa đơn, đồng thời làm căn cứ hạch toán và kê khai thuế.
4. Quy trình thực hiện xuất hóa đơn hợp đồng hợp tác kinh doanh
Bước 1: Xác định bên lập hóa đơn
Các bên đối chiếu hợp đồng và giao dịch thực tế để xác định bên trực tiếp bán hàng hóa hoặc cung cấp dịch vụ cho khách hàng. Sau đó xác định thời điểm lập hóa đơn theo Điều 9 Nghị định số 254/2026/NĐ-CP.
Bước 2: Xác định nội dung và giá trị hóa đơn
Bên có trách nhiệm lập hóa đơn xác định chính xác hàng hóa, dịch vụ, số lượng, đơn giá, thành tiền và các nội dung về thuế. Thông tin trên hóa đơn phải phù hợp với giao dịch thực tế và hồ sơ hợp tác.
Bước 3: Lập và gửi hóa đơn điện tử
Doanh nghiệp lập hóa đơn điện tử theo quy định tại Điều 10 Nghị định số 254/2026/NĐ-CP, hoàn tất các yêu cầu về ký, truyền nhận và gửi hóa đơn cho khách hàng theo loại hóa đơn được sử dụng.
Bước 4: Hạch toán và kê khai thuế
Sau khi lập hóa đơn, các bên căn cứ vào hợp đồng, hóa đơn và chứng từ thực tế để hạch toán phần doanh thu, chi phí hoặc lợi ích được hưởng. Nghĩa vụ kê khai và nộp thuế được thực hiện theo quy định thuế tương ứng với hoạt động hợp tác.
5. Câu hỏi thường gặp
Hợp đồng hợp tác kinh doanh có bắt buộc phải xuất hóa đơn không?
Hợp đồng hợp tác kinh doanh không phải tự thân là căn cứ để lập hóa đơn. Nghĩa vụ lập hóa đơn phát sinh khi có hoạt động bán hàng hóa, cung cấp dịch vụ thuộc trường hợp phải lập hóa đơn. Bên trực tiếp thực hiện giao dịch với khách hàng cần xác định và thực hiện nghĩa vụ lập hóa đơn theo quy định hiện hành.
Các bên trong hợp đồng có thể tự thỏa thuận bên nào xuất hóa đơn không?
Các bên có thể thỏa thuận về cách thức tổ chức và phân công công việc trong hợp đồng hợp tác, nhưng việc xác định nghĩa vụ lập hóa đơn vẫn phải phù hợp với bản chất giao dịch và pháp luật về hóa đơn. Vì vậy, không phải cứ thỏa thuận một bên xuất hóa đơn là có thể áp dụng cho mọi trường hợp. Doanh nghiệp cần xác định bên thực tế bán hàng hóa hoặc cung cấp dịch vụ và căn cứ hồ sơ giao dịch để thực hiện.
Thời hạn xuất hóa đơn sau khi nhận thanh toán là bao lâu?
Không có một thời hạn chung áp dụng cho mọi giao dịch hợp tác kinh doanh chỉ căn cứ vào thời điểm nhận thanh toán. Thời điểm lập hóa đơn được xác định theo Điều 9 Nghị định số 254/2026/NĐ-CP, tùy thuộc giao dịch là bán hàng hóa hay cung cấp dịch vụ và trường hợp thanh toán cụ thể. Đối với dịch vụ, cần lưu ý thời điểm hoàn thành dịch vụ và trường hợp thu tiền trước hoặc trong khi cung cấp dịch vụ.
Xuất hóa đơn hợp đồng hợp tác kinh doanh đúng quy định sẽ giúp doanh nghiệp tránh rủi ro pháp lý và tối ưu hóa nghĩa vụ thuế. Để được hỗ trợ chi tiết và thực hiện thủ tục nhanh chóng, hãy liên hệ ACC Cần Thơ ngay hôm nay.
Để lại một bình luận